makomoさん
こんにちは。コケの発生は安定するまでの時期に必ずぶつかる壁ですね。
基本的に撲滅するのは困難ですので、掃除をしながら少しづつコケの成長スピードを抑えていくイメージで付き合っていくといいと思います。
ハギや、ギンポなどの魚を追加するか、魚が難しいなら貝やウニ等の生物を追加してみてもいいかもしれません。
後は、栄養塩の状況を確認してみてはいかがでしょうか？
硝酸塩やリン酸などを測定して高い値が出ている場合は、NO3:PO4-X等の炭素源を添加すると藻類の発生を抑えることができるはずです。
照明は6－12時間程度が目安といわれています。落ち着くまで照明時間を調整するのも一つの方法かもしれません。タイマーを使用していなければタイマーの導入も検討してみてはどうでしょうか。
参考になればいいのですが